57 Jahre sind vergangen, seit die Besatzung der 'Nostromo' von den Aliens umgebracht wurde, als Deckoffizier Ripley (Sigourney Weaver), die einzige Überlebende des Massakers, in einem kleinen Rettungsschiff in der Hyperschlaf-Kabine gefunden wird. Die sie vernehmenden Offiziere der Raumstation schenken ihren Schilderungen der furchtbaren Ereignisse jedoch keinen Glauben. Sie schlagen auch ihre Warnung in den Wind, dass sich durch das infizierte Raumschiff 'Nostromo' nun tausende von Alien-Eiern auf dem Planeten 'LV 426' befinden, der jetzt 'Acheron' heißt und seit 20 Jahren für Kolonisationszwecke bewohnbar gemacht wird. Da jedoch seit einiger Zeit zu dem Planeten kein Funkkontakt mehr besteht, wird ein Suchtrupp unter Ripleys Führung mit Corporal Hicks (Michael Biehn) und Bishop (Lance Henriksen) dorthin gesandt. Bei der Erforschung des offenbar völlig verwaisten Planeten stößt die Elite-Einheit auf Spuren blutiger Kämpfe, und auf Newt (Carrie Henn). In merkwürdig verwobenen Höhlengängen beginnt der Kampf von neuem. Unzählige Aliens haben den Planeten in Besitz genommen - gefährlicher, furchtbarer und vernichtender als je zuvor.