Auf einer Insel werden zu Forschungszwecken mutierte Saurier gehalten. Unter ihnen 'Godzilla' mit seinem Jungen. Eines Tages überwinden die Tiere die elektrischen Zäune und brechen aus. Raumschiffkapitän Katsuo Yamabe (Akira Kubo) stellt fest, dass die Bewohner der Insel und die Saurier per implantierter Minisender ferngesteuert werden. Drahtzieher sind die Bewohner des Planeten 'Kilaak'. Die Aliens senden ihre eigenen Monster und ein bewaffnetes UFO zur Erde. Eine fürchterliche Schlacht beginnt und als alles verloren scheint, schlagen sich Godzilla und seine Artgenossen auf die Seite der Menschen.